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基因检测全解读:你想知道的都在这里

2025-05-15

  在当今精准医疗的时代,肿瘤基因检测能为患者提供更精准,更个性化的治疗方案。无论是靶向药物的选择,还是复发转移风险的评估,基因检测都在发挥着至关重要的作用。本文将带您深入了解肿瘤基因检测的方方面面,让复杂的基因检测变得简单明了。


      肿瘤基因检测的目的:

      1.筛选靶向药物


  目前包括Braf,Nras,Kit,CDKM2A等在内的部分恶黑驱动基因都有对应的靶向药物,均为口服药物,用药方便,且有效率高。检测的目的就是确认这些靶点基因是否有突变,是否可以使用对应的靶向药物。医生可以根据检测结果制定最优治疗方案。使后续治疗和用药变得更有针对性和更精准。

    2.评估免疫治疗效果


  包括TMB(肿瘤突变负荷)包括MSS微卫星状态在内的检测结果以及部分对免疫治疗产生正面或负面影响的基因变异的信息,都能很好的为后续的免疫治疗的效果评估提供参考。


    3.评估复发转移风险


  已有大量临床数据证实,有包括Braf,Nras,Kit等在内的重要驱动基因突变的患者,相较未突变的患者,预后相对较差,并且更容易复发转移。所以通过基因检测可以对预后有个大致的评估和了解,同时根据检测结果对治疗方案和复查频率做出相应的调整。

  其次,通过结合最新的MRD(微小残留肿瘤细胞)检测技术,也能更早更准确的评估术后的复发转移风险,和抗肿瘤治疗的效果。


    4.评估免疫治疗超进展风险


  研究表明年龄≥65岁高龄患者、携带超进展风险基因突变并伴有多发转移和局部复发的患者容易发生免疫治疗超进展。所以通过检测是否有超进展的风险基因突变,可以很好的提前对免疫治疗的超进展风险有个大致的了解和评估。

  肿瘤基因检测需要准备哪些东西:


     基因检测需要准备的最重要的就是含有肿瘤细胞的受检标本。


  很多人会问为什么一定要求标本里含有肿瘤细胞呢?答案很简单,因为我们做基因检测的目的就是为了想知道患者肿瘤细胞里是否携带驱动基因突变,是否能使用靶向药治疗。所以要是样本里没有肿瘤细胞,我们做检测就没任何意义了。

  所以在条件允许的情况下,推荐首选肿瘤病理组织进行检测,例如(蜡块,白片,穿刺物)因为其所用标本的肿瘤细胞含量远高于血液、胸腹水等其他标本类型,因此对组织标本进行检测和分析所得的结果会更加精准可靠。


     组织基因检测是肿瘤基因检测的“金标准”。蜡块,白片,染色片究竟是什么?


       手术中切取的人体组织叫标本,标本被送到病理科,经甲醛固定、乙醇脱水、石蜡包埋后制成的组织块,简称蜡块


  将蜡块在切片机上切成薄片,黏附在玻片上,然后贴在一个玻璃片(载玻片)上,就做成了病理切片。也就是我们平时所说的白片。白片也可以理解是白色的、切好未经染色的片子。

  染色片是白片经过染色、封片等程序制成的切片。染色切片分为很多种,根据显微镜下观察细胞结构的不同需要,做不同的染色,最常见的例如HE切片、免疫组化切片、特殊染色切片等。


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  由于蜡块医院通常不愿外借。所以做基因检测最好的选择就是白片。白片可以在手术医院的病理科进行购买,通常需要15张左右,厚度3-5微米,无需挂胶烤片(如已烤片和挂胶也不影响检测)。各个医院病理科购买白片的流程不一样。患者本人或其家属都可以办理。部分医院可能需要切片外借申请单。而对于难以获取组织样本的患者或者病理诊断后组织样本量不足的患者,如果有多个病灶或多发转移的患者,可以考虑使用外周血,胸腹水。而脑转移患者(包括脑实质性转移和脑膜转移)可以考虑使用脑脊液。

  基因检测流程:


      1.准备受检标本(蜡块,组织白片,穿刺物,外周血,胸腹水,脑脊液);


     2.填写检测申请单;


     3.寄送至检测中心或交给医院。


     基因检测方法:


      一代PCR测序:只能检测个别基因点位。人工成本高。


  二代NGS测序:可同时检测成千上百的基因点位。与一代测序相比,二代NGS测序具有通量高、测序成本相对较低的特点。是目前主流的基因检测方法。

  免疫组化IHC:可用于个别基因的初筛。

  原位杂交FISH:通常用来检测个别基因的扩增、缺失及重排,例如HER2。如何选择基因检测机构选择国家批准的、正规的、有资质的检测公司或自身有检测资质和能力的医院。


     基因检测是不是做一次就够了?哪些情况可能需要多次检测?


      在患者治疗的过程中,的确会存在可能需要做多次基因检测的情况。


  例如:1.发生转移的患者,新的转移灶可能发生新的基因变异。

  2.患者在进行靶向治疗的过程中,可能会出现耐药、疾病进展。

  所以当需要判断新的转移灶或者治疗过程中是否有新的基因变异时,以及查找耐药原因时。会需要进行新的基因检测。


    肿瘤基因检测费用大概是多少?


      目前肿瘤基因检测的费用大致在几千元至上万元不等,主要区别在于检测机构的不同,检测手段的不同和检测基因数量的不同。通常检测基因的数量和项目越多,检测费用也会越贵。而目前最为患者和家属诟病和不满的就是因为送检渠道的不同,肿瘤基因检测的价格也是天差地别,相差悬殊。而有许多患者因为一部分无良的从业人员和医生的无良行为,一不小心就花了高价,心里顿时有种被坑的感觉。所以建议大家在做基因检测之前最好多在病友群里问问病友,听听他们的经验再做决定,从而避免不必要的花费。


     肿瘤基因检测是否纳入了医保?商业保险是否可以报销?


       目前国内大部分省市未纳入医保范畴。只有个别省市的个别医院以及针对部分癌种的个别驱动基因的检测纳入了医保范畴。其中北京协和医院,福建省肿瘤医院的部分检测项目可以按医保报销一部分的费用,详情可咨询当地医保局和相关医院。


  而很多商业保险的报销范围都包括了肿瘤用药基因检测,所以投保了商业险的患者可以咨询投保的保险公司以了解详情。


    关于病理组织标本的时效性


     病理组织最好是距离手术1年以内的标本,如果超过1年,由于氧化等原因,随着年限的增长,会出现DNA的断链,损伤,以及蛋白降解。不利于检测的准确性。


      白片厚度,以及是否需要挂胶,烤片


      厚度:3至5微米基因检测用的白片无需挂胶,烤片。如果已经挂胶,烤片也不影响基因的检测。


     寄送受检标本时是否需要冷链


    通常情况下无需冷链寄送肿瘤基因检测产品怎么选大家通常在做基因检测前不知道应该选哪一个检测产品。


  通常推荐做2代NGS的测序。因为2代测序可以同时检测几百至几千个的基因点位,大大提高了检测效率和检出率,同时也降低了单个基因检测的成本。

  而2代测序中,往往又分成大panel,中panel,和小panel。

  大panel通常指的是大通量的基因测序。也就是能够检测几百至上千个基因点位的基因检测。而中panel指的是检测100至200个左右的基因点位。小panel指的是只检测几个或十几个的基因点位。所以简单来说,panel越大,意味着检测的基因点位越多,覆盖面越广。

  所以在选择肿瘤基因检测产品时,首先看检测的基因点位数量。通常检测的数量越多,产品的价格也就越贵。其次看检测基因列表,其中是否包含了所患肿瘤的驱动基因以及可用靶向药基因的检测。如果不包含,那么测得再多也没任何意义。

  综上所述,只要条件允许,通常首次做肿瘤基因检测的患者,我们还是推荐做大panel的基因检测。因为覆盖面广,基本包含了所有的驱动基因和靶点基因的检测。其次像TMB(肿瘤突变负荷)这样的数据也只有大panel的基因检测才有。而且现在很多的MRD(微小残留肿瘤细胞)检测也都要依赖于大panel的基因检测作为基础。

  当然也不是说基因检测一定是检测的点位越多越好。因为目前有临床实际意义和靶向药可用的基因也就只有一小部分。所以根据患者自身的需求,自身的经济条件,选择最适合自己的肿瘤基因检测产品才是最正确的选择。简单总结一下:如果只是单纯筛选肿瘤靶向药物,那选小panel和中panel的基因检测产品即可。

  如果除了筛选靶向药物以外,还想评估免疫治疗效果,评估复发转移风险,评估免疫治疗超进展风险。以及可能会考虑做MRD检测的。建议还是选大panel的基因检测产品。

  基因常见变异的类型:点突变:DNA单个碱基或碱基对的改变。

  扩增:基因拷贝数增加或表达活性增强。

  融合:指两个基因的部分或全部序列相互融合为一个新的基因。

  缺失:指由于染色体缺失而伴有的基因缺失。

  什么是体系突变和胚系突变:体系突变:后天由于各种原因造成和引起的、非遗传带来的突变。

  是肿瘤细胞样本独有的突变。大部分的癌症是由体系突变引起的,不具有遗传性。

  胚系突变:个体先天带来的遗传信息。也就是来自于父亲或来自于母亲,从个体一出生就携带的突变信息,也可以遗传给后代。这类突变通常都有家族史,而且有较高的遗传风险。什么是突变丰度:指代的是检出突变基因占整体的比例。一般指在基因检测结果中,某个基因的突变型在所有等位基因(突变型和野生型)中的所占的比例。

  通常突变丰度越高,说明肿瘤组织中含有这种突变基因的细胞数越多。

  所以通常突变丰度越高,也就越有可能从靶向药治疗中获益,但这也不是绝对的。TMB(肿瘤突变负荷)是什么:TMB是指肿瘤基因组去除胚系突变后的突变的数量。定义为每百万碱基中被检测出的,基因编码错误、碱基替换、基因插入或缺失错误的总数。具有高TMB的肿瘤细胞具有较高的新抗原水平,这被认为可以帮助免疫系统识别肿瘤并刺激抗肿瘤T细胞的增殖和抗肿瘤反应。所以理论上,TMB越高,能够被T细胞识别的新抗原产生也越多,接受免疫检查点抑制剂治疗(PD-1/PD-L1)的疗效可能就越好。当然这也不是绝对的。

  因为大部分的黑色素瘤患者的TMB(肿瘤突变负荷)通常都不高,但其中也有许多免疫治疗效果很好的患者。所以简单总结一下:如果TMB高,免疫治疗有效率高。如果TMB低,也不影响免疫治疗的使用。微卫星状态(MSI)是什么:根据微卫星状态可分为以下三类:微卫星高度不稳定(MSI-high,MSI-H)、微卫星低度不稳定(MSI-low,MSI-L)和微卫星稳定(microsatellite stability,MSS)。

  微卫星高度不稳定(MSI-H)患者对免疫疗法更加敏感,能够从免疫检查点抑制剂中获益,且与具体癌种无关。因此,MSI已成为所有实体瘤中免疫治疗疗效的预测因子。但黑色素瘤MSI-H发生率相对较低,只有极少一部分恶黑患者出现MSI-H的情况。PD-L1检测是否有意义?怎么做?在哪里做?PD-L1检测是通过PD-L1抗体检测试剂,用免疫组织化学方法进行染色、判读后,确定肿瘤组织中PD-L1的表达水平。

  PD-L1表达是PD-1/PD-L1抑制剂疗效预测的生物标志物。许多临床试验显示,PD-L1表达越高,免疫治疗的有效率越高。但这也不是绝对的。特别是在黑色素瘤群体,也有许多PD-L1低表达和阴性的患者从免疫治疗中获益。其次PD-L1表达并不是唯一的疗效预测生物标志物,如TMB(肿瘤突变负荷)/MSI(微卫星状态)状况等等对免疫治疗疗效预测同样有参考意义。

  所以如果条件允许,可以考虑做一下PD-L1检测。毕竟如果测出来是高表达,那么对免疫治疗还是有一定的参考意义。如果没有测,而且已经在使用PD-1/PD-L1了。那么也没关系。特别是黑色素瘤的患者,这个检测只是个参考,并不作为是否用免疫治疗的依据。

  PD-L1的检测通常只需5张白片即可。检测的方法通常是免疫组化的方式。医院病理科和第三方基因检测公司都可以做。但通常医院病理科做的话会相对便宜一些。所以如需检测PD-L1,可以考虑首选去医院的病理科进行检测。通常也就几百块钱。黑色素瘤是否会遗传:

  这也是众多患者及家属非常关心的问题。中国黑色素瘤和欧美白种人不同,遗传引起的黑色素瘤并不多见。再结合国内黑色素瘤较低的发病率,总体来说遗传风险并不高。很少见到一个家族有多人患黑色素瘤的情况。但如果家族中有超过两人以上患有黑色素瘤,那就要引起重视了,并建议一级亲属最好做一下遗传风险的基因检测。如果检测结果存在遗传风险胚系基因(例如CDKN2A等)的变异情况,那就要引起高度重视,务必定期进行体检,保持健康的生活方式。从而更好的做到早预防和早发现。

  在众多遗传胚系基因变异中,要重点关注的是CDKN2A。因为CDKN2A胚系突变和黑色素瘤的遗传风险关系最为密切。而且CDKN2A的胚系突变不仅会增加黑色素瘤、胰腺癌和神经系统肿瘤的患病风险外,还与其他多种癌症相关,包括乳腺癌、肺腺癌、肉瘤和神经纤维瘤。免疫超进展(HPD)的定义和风险基因有哪些:免疫超进展又称为免疫治疗爆发式进展,目前免疫超进展尚无标准定义,通常认为在接受PD-1/PD-L1抑制剂治疗后,2个月内肿瘤负荷相比于基线增加超过50%;肿瘤生长速度超过之前速度2倍以上。

  黑色素瘤患者免疫超进展的发生率在10%左右。出现超进展(HPD)的患者总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)更短。免疫治疗超进展相关的风险基因列表:MDM2/MDM4基因扩增EGFR变异CCND1/FGF3/FGF4/FGF19等(11号染色体13区带相关基因)11q13扩增研究表明年龄≥65岁高龄患者、并携带以上超进展风险基因突变并伴有多发转移和局部复发的患者容易发生超进展。不做基因检测是否能用靶向药?从广义上说,靶向药可以分为两类:

  一类是作用于肿瘤细胞特定靶点的靶向药物,此类靶向药物只针对肿瘤特定基因的突变,所以精准性高特异性强。使用前必须做基因检测,并要有对应特定靶点基因的变异才能使用。我们通常所说的靶向药,多数是指的此类靶向药物。例如:达拉非尼,曲美替尼,康奈非尼,比美替尼等等。

  另一类是作用于血管的拥有多靶点的广谱抗肿瘤血管生成的靶向药。此类抗血管靶向药无需基因检测即可使用。例如:仑伐替尼,阿昔替尼,阿帕替尼,安罗替尼,贝伐珠单抗等等。送检后多久能收到报告:根据检测方法的不同,检测机构的不同,出报告的时间也有所不同。通常会在5-10个工作日左右。常见体系基因变异列表:BRAF(原癌基因)

  BRAF基因的突变是黑色素瘤最重要的驱动基因突变,其中V600(e/k)位点突变占80%-90%;国内恶黑患者整体BRAF突变发生率在25%左右。在皮肤型的恶黑患者中突变发生率会更高一些。BRAF突变患者起病早,发展快,初诊时分期偏晚,远处转移特别是脑转移发生风险高。而V600k脑转发生率高于V600e突变患者。BRAF突变患者复查时建议增加脑部核磁的检查。

  在所有位点中V600(E/K),V600R/M/D/G对靶向药最为敏感,有效率也最高。而K601E/N/T、L597Q/V、G469A/V/R、G464V/E等罕见点位的突变对靶向药也有响应。

  而BRAF融合的患者可能对MEK抑制剂以及BRAF和MEK抑制剂联合使用产生应答。同时泛RAF抑制剂(如索拉非尼)也可能对BRAF融合的患者有效。

  对应靶向药:达拉非尼,曲美替尼,康奈非尼,比美替尼,维莫非尼,考比替尼NRAS(原癌基因)

  重要的驱动基因之一。国内患者突变发生率在10%-15%,其中Q61K/R点位的突变最为常见。预后较差,肿瘤的侵袭性高,免疫治疗容易原发耐药。易复发,无进展生存期短。

  对应靶向药:妥拉美替尼,比美替尼,曲美替尼KIT(原癌基因)

  在国内黑色素瘤患者中KIT突变发生率在10%-15%,其中黏膜和肢端黑色素瘤最为常见。预后相对较差。

  KIT外显子11和13突变(如W557、V559、L576P、K642E)对KIT抑制剂(靶向药)可能具有高度敏感性。

  KIT外显子17突变(如D816H)对KIT抑制剂的敏感性很低;KIT扩增对KIT抑制剂(靶向药)的敏感性低或无反应。

  对应靶向药:伊马替尼、舒尼替尼、尼洛替尼,瑞派替尼TERT(原癌基因)

  预后不良,容易脑转。而BRAF合并TERT突变的患者,对BRAF和MEK抑制剂的联合治疗更敏感,效果更佳。CDKN2A(抑癌基因)

  国内黑色素瘤患者很多都存在CDKN2A的缺失。并且有超过半数的患者可能都存在CDK4、CCND1和CDKN2A这三个基因中一个基因的拷贝数变化。

  而CDKN2A缺失不仅帮助肿瘤快速生长,而且同时能促进黑色素细胞的运动和迁移,并能在体内促使黑色素瘤发生远端转移。

  对应靶向药:哌柏西利,瑞波西利,阿贝西利。PTEN(抑癌基因)

  PTEN基因的失活突变往往容易引起脑转移。并且容易引起靶向药和免疫治疗的耐药。TP53(抑癌基因)

  是细胞生长,增殖和损伤修复的重要调节因子。粘膜型恶黑中较常见。预后相对较差。目前没有上市的靶向药。可以关注相关的临床实验。

  结语:总之,肿瘤基因检测在肿瘤精准治疗中起着至关重要的作用。建议大家在检测前多了解相关知识

  希望通过这篇文章能帮助更多的患者和家属在治疗的道路上少走一些弯路。如果大家有任何关于基因检测的问题和需求,欢迎大家加我的微信咨询:微信:19121190993